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Zoological Research

Number 1, 2024

  • 1−12
    Surviving winter on the Qinghai-Xizang Plateau: Extensive reversible protein phosphorylation plays a dominant role in regulating hypometabolism in hibernating Nanorana parkeri
    Authors: Yong-Gang Niu, Deng-Bang Wei, Xue-Jing Zhang, Ti-Sen Xu, Xiang-Yong Li, Hai-Ying Zhang, Zhi-Fang An, Kenneth B. Storey, Qiang Chen
    Number of views: 6
  • 13−24
    Full T-cell activation and function in teleosts require collaboration of first and co-stimulatory signals
    Authors: Wei Liang, Kang Li, Haiyou Gao, Kunming Li, Jiansong Zhang, Qian Zhang, Xinying Jiao, Jialong Yang, Xiumei Wei
    Number of views: 7
  • 25−35
    LncRNA pol-lnc78 as a ceRNA regulates antibacterial responses via suppression of pol-miR-n199-3p-mediated SARM down-regulation in Paralichthys olivaceus
    Authors: Xian-Hui Ning, Bing Han, Ye Peng, Shao-Wu Yin
    Number of views: 7
  • 39−54
    Dynamic foraging strategy adaptation to heterogeneous environments contributes to social aggregation in snub-nosed monkeys
    Authors: Lan Zhao, Sheng-Nan Ji, Xiao-Bing Du, Jia-Hui Liu, Bo-Lun Zhang, Pei-Hua Li, Yi-Jun Yang, Bao-Guo Li, Yan-Qing Guo, Xiao-Guang Qi
    Number of views: 3
  • 55−68
    Single-cell profiling of the pig cecum at various developmental stages
    Authors: Yan-Yuan Xiao, Qing Zhang, Fei Huang, Lin Rao, Tian-Xiong Yao, Si-Yu Yang, Lei Xie, Xiao-Xiao Zou, Li-Ping Cai, Jia-Wen Yang, Bin Yang, Lu-Sheng Huang
    Number of views: 4
  • 69−78
    Unexpected divergence in magnetoreceptor MagR from robin and pigeon linked to two sequence variations
    Authors: Shun Wang, Peng Zhang, Fan Fei, Tianyang Tong, Xiujuan Zhou, Yajie Zhou, Jing Zhang, Mengke Wei, Yanqi Zhang, Lei Zhang, Yulong Huang, Lin Zhang, Xin Zhang, Tiantian Cai, Can Xie
    Number of views: 3
  • 79−94
    Loss of LBP triggers lipid metabolic disorder through H3K27 acetylation-mediated C/EBPβ-SCD activation in non-alcoholic fatty liver disease
    Authors: Ya-Ling Zhu, Lei-Lei Meng, Jin-Hu Ma, Xin Yuan, Shu-Wen Chen, Xin-Rui Yi, Xin-Yu Li, Yi Wang, Yun-Shu Tang, Min Xue, Mei-Zi Zhu, Jin Peng, Xue-Jin Lu, Jian-Zhen Huang, Zi-Chen Song, Chong Wu, Ke-Zhong Zheng, Qing-Qing Dai, Fan Huang, Hao-Shu Fang
    Number of views: 3
  • 95−107
    Comprehensive analysis of the gut microbiome and post- translational modifications elucidates the route involved in microbiota-host interactions
    Authors: Hai-Yang Wang, Lan-Xiang Liu, Xue-Yi Chen, Yang-Dong Zhang, Wen-Xia Li, Wen-Wen Li, Lian Wang,  Xiao-Long Mo, Hong Wei, Ping Ji, Peng Xie
    Number of views: 4
  • 108−124
    Cath-KP, a novel peptide derived from frog skin, prevents oxidative stress damage in a Parkinson’s disease model
    Authors: Huanpeng Lu, Jinwei Chai, Zijian Xu, Jiena Wu, Songzhe He, Hang Liao, Peng Huang, Xiaowen Huang, Xi Chen, Haishan Jiang, Shaogang Qu, Xueqing Xu
    Number of views: 3
  • 125−135
    Patterns and drivers of avian taxonomic and phylogenetic beta diversity in China vary across geographical backgrounds and dispersal abilities
    Authors: Jian-Chao Liang, Zhi-Feng Ding, Chun-Lin Li, Yi-Ming Hu, Zhi-Xin Zhou, Gan-Wen Lie, Xiao-Nan Niu, Wen-Bin Huang, Hui-Jian Hu, Xing-Feng Si
    Number of views: 3
  • 138−151
    Pig H3K4me3, H3K27ac, and gene expression profiles reveal reproductive tissue-specific activity of transposable elements
    Authors: Tao Jiang, Zhi-Min Zhou, Zi-Qi Ling, Qing Zhang, Zhong-Zi Wu, Jia-Wen Yang, Si-Yu Yang, Bin Yang Lu-Sheng Huang
    Number of views: 3
  • 152−159
    Indian monsoon drove the dispersal of the thoracica group of Scytodes spitting spiders
    Authors: Yu-Fa Luo, Shu-Qiang Li
    Number of views: 3
  • 160−175
    Comparative analyses of mitogenomes in the social bees with insights into evolution of long inverted repeats in the Meliponini
    Authors: Yu-Ran Li, Zheng-Wei Wang, Richard T. Corlett, Wen-Bin Yu
    Number of views: 3
  • 176−188
    Endogenous biosynthesis of docosahexaenoic acid (DHA) regulates fish oocyte maturation by promoting pregnenolone production
    Authors: Yi Li, Xuehui Li, Ding Ye, Ru Zhang, Chengjie Liu, Mudan He, Houpeng Wang, Wei Hu, Yonghua Sun
    Number of views: 4
  • 189−200
    Core and variable antimicrobial resistance genes in the gut microbiomes of Chinese and European pigs
    Authors: Cui-Hong Tong, Zhi-Peng Huo, Lu Diao, Dan-Yu Xiao, Ruo-Nan Zhao, Zhen-Ling Zeng, Wen-Guang Xiong
    Number of views: 3
  • 201−214
    Combined ATAC-seq, RNA-seq, and GWAS analysis reveals glycogen metabolism regulatory network in Jinjiang oyster (Crassostrea ariakensis)
    Authors: Biao Wu, Xi Chen, Jie Hu, Zhen-Yuan Wang, Yan Wang, Da-You Xu, Hao-Bing Guo, Chang-Wei Shao, Li-Qing Zhou, Xiu-Jun Sun, Tao Yu, Xiao-Mei Wang, Yan-Xin Zheng, Guang-Yi Fan, Zhi-Hong Liu
    Number of views: 3
  • 215−225
    Molecular phylogenetic relationships based on mitochondrial genomes of novel deep-sea corals (Octocorallia: Alcyonacea): Insights into slow evolution and adaptation to extreme deep-sea environments
    Authors: Zhan-Fei Wei, Kai-Wen Ta, Nan-Nan Zhang, Shan-Shan Liu, Liang Meng, Kai-Qiang Liu, Chong-Yang Cai, Xiao-Tong Peng, Chang-Wei Shao
    Number of views: 4

Number 6, 2023

  • 993−1002
    Multiplex gene editing reduces oxalate production in primary hyperoxaluria type 1
    Authors: Rui Zheng, De-Xin Zhang, Yan-Jiao Shao, Xiao-Liang Fang, Lei Yang, Ya-Nan Huo, Da-Li Li, Hong-Quan Geng
    Number of views: 9
  • 1003−1014
    Anti-infection effects of heparin on SARS-CoV-2 in a diabetic mouse model
    Authors: Zhongyun Zhang, Ning Zhang, Xuancheng Lu, Min Zhou, Xiaoxiang Yan, Weiqiong Gu, Jingru Yang, Qin Zhang, Cheng Zhang, Yuhuan Gong, Mingjun Jia, Xiaoyu Zhang, Peng Ning, Mei Liu, Xiaoyan Li, Xiaomeng Shi, Wenjun Liu, George F. Gao, Guang Ning, Jiqiu Wang, Yuhai Bi
    Number of views: 6
  • 1015−1025
    Cross-species recognition of bat coronavirus RsYN04 and cross-reaction of SARS-CoV-2 antibodies against the virus
    Authors: Runchu Zhao, Sheng Niu, Pu Han, Yue Gao, Dezhi Liu, Chunliang Luo, Honghui Liu, Bo Liu, Yanli Xu, Jianxun Qi, Zhihai Chen, Weifeng Shi, Lili Wu, George F. Gao, Qihui Wang
    Number of views: 9
  • 1026−1038
    BARN: Behavior-Aware Relation Network for multi-label behavior detection in socially housed macaques
    Authors: Sen Yang, Zhi-Yuan Chen, Ke-Wei Liang, Cai-Jie Qin, Yang Yang, Wen-Xuan Fan, Chen-Lu Jie, Xi-Bo Ma
    Number of views: 9
  • 1039−1051
    Hiding on jagged karst pinnacles: A new microendemic genus and species of a limestone-dwelling agamid lizard (Squamata: Agamidae: Draconinae) from Khammouan Province, Laos
    Authors: Saly Sitthivong, Peter Brakels, Santi Xayyasith, Nathanaël Maury, Sabira Idiiatullina, Parinya Pawangkhanant, Kai Wang, Tan Van Nguyen, Nikolay A. Poyarkov
    Number of views: 7
  • 1052−1063
    Comparative genomics of widespread and narrow-range white-bellied rats in the Niviventer niviventer species complex sheds light on invasive rodent success
    Authors: Xin-Lai Wu, Dan-Ping Mu, Qi-Sen Yang, Yu Zhang, Yu-Chun Li, Anderson Feijó, Ji-Long Cheng, Zhi-Xin Wen, Liang Lu, Lin Xia, Zhi-Jun Zhou, Yan-Hua Qu, De-Yan Ge
    Number of views: 8
  • 1064−1079
    Improved mammalian family phylogeny using gap-rare multiple sequence alignment: A timetree of extant placentals and marsupials
    Authors: Gao-Ming Liu, Qi Pan, Juan Du, Ping-Fen Zhu, Wei-Qiang Liu, Zi-Hao Li, Ling Wang, Chun-Yan Hu, Yi-Chen Dai, Xiao-Xiao Zhang, Zhan Zhang, Yang Yu, Meng Li, Peng-Cheng Wang, Xiao Wang, Ming Li, Xu-Ming Zhou
    Number of views: 6
  • 1080−1094
    Characterization of long-term ex vivo expansion of tree shrew spermatogonial stem cells
    Authors: Cong Li, Rui Bi, Lin Wang, Yu-Hua Ma, Yong-Gang Yao, Ping Zheng
    Number of views: 7
  • 1095−1114
    Design methods for antimicrobial peptides with improved performance
    Authors: James Mwangi, Peter Muiruri Kamau, Rebecca Caroline Thuku, Ren Lai
    Number of views: 7
  • 1115−1131
    From beasts to bytes: Revolutionizing zoological research with artificial intelligence
    Authors: Yu-Juan Zhang, Zeyu Luo, Yawen Sun, Junhao Liu, Zongqing Chen
    Number of views: 7
  • 1132−1145
    Targeting autophagy in Alzheimer’s disease: Animal models and mechanisms
    Authors: Xiao-Wen Zhang, Xiang-Xing Zhu, Dong-Sheng Tang, Jia-Hong Lu
    Number of views: 8

Number 5, 2023

  • 837−847
    Population genetics of marmosets in Asian primate research centers and loci associated with epileptic risk revealed by whole-genome sequencing
    Authors: Xiangyu Yang, Yafei Mao, Xuan-Kai Wang, Dong-Ni Ma, Zhen Xu, Neng Gong, Barbara Henning, Xu Zhang, Guang He, Yong-Yong Shi, Evan E. Eichler, Zhi-Qiang Li, Eiki Takahashi, Wei-Dong Li
    Number of views: 32
  • 848−859
    ATF6 aggravates apoptosis in early porcine embryonic development by regulating organelle homeostasis under high-temperature conditions
    Authors: Ming-Hong Sun, Wen-Jie Jiang, Xiao-Han Li, Song-Hee Lee, Geun Heo, Dongjie Zhou, Zhi Chen, Xiang-Shun Cui
    Number of views: 29
  • 860−866
    Identifying priority protection areas of key food resources of the giant panda
    Authors: Ying-Jie Ma, Meng Wang, Xiao-Yu Hu, Xiao-Dong Gu, Yu-Mei Li, Fu-Wen Wei, Yong-Gang Nie
    Number of views: 26
  • 867−881
    Long-term potentiation-based screening identifies neuronal PYGM as a synaptic plasticity regulator participating in Alzheimer’s disease
    Authors: Ting Wang, Yun-Qiang Zhou, Yong Wang, Liang Zhang, Xiang Zhu, Xiu-Yan Wang, Jing-Hui Wang, Lin-Kun Han, Jian Meng, Xian Zhang, Hong Luo, Qi-Lin Ma, Zhan-Xiang Wang, Yun-Wu Zhang
    Number of views: 25
  • 882−893
    Probing the processing of facial expressions in monkeys via time perception and eye tracking
    Authors: Xin-He Liu, Lu Gan, Zhi-Ting Zhang, Pan-Ke Yu, Ji Dai
    Number of views: 29
  • 894−904
    Dihydroartemisinin inhibits plasmid transfer in drug-resistant Escherichia coli via limiting energy supply
    Authors: Xue-Yang Wang, Huang-Wei Song, Tian Yi, Ying-Bo Shen, Chong-Shan Dai, Cheng-Tao Sun, De-Jun Liu, Jian-Zhong Shen, Cong-Ming Wu, Yang Wang
    Number of views: 26
  • 905−918
    Choline dehydrogenase interacts with SQSTM1 to activate mitophagy and promote coelomocyte survival in Apostichopus japonicus following Vibrio splendidus infection
    Authors: Lian-Lian Sun, Ying-Fen Dai, Mei-Xiang You, Cheng-Hua Li
    Number of views: 28
  • 919−931
    Anthropogenic activity, hydrological regime, and light level jointly influence temporal patterns in biosonar activity of the Yangtze finless porpoise at the junction of the Yangtze River and Poyang Lake, China
    Authors: Peng-Xiang Duan, Zhi-Tao Wang, Tomonari Akamatsu, Nick Tregenza, Guang-Yu Li, Ke-Xiong Wang, Ding Wang
    Number of views: 28
  • 954−966
    Hypoxia tolerance in fish depends on catabolic preference between lipids and carbohydrates
    Authors: Qiang Ma, Yuan Luo, Jia Zhong, Samwel  Mchele Limbu, Ling-Yu Li, Li-Qiao Chen, Fang Qiao, Mei-Ling Zhang, Qiang Lin, Zhen-Yu Du
    Number of views: 27
  • 967−980
    Deep learning-based activity recognition and fine motor identification using 2D skeletons of cynomolgus monkeys
    Authors: Chuxi Li, Zifan Xiao, Yerong Li, Zhinan Chen, Xun Ji, Yiqun Liu, Shufei Feng, Zhen Zhang, Kaiming Zhang, Jianfeng Feng, Trevor W. Robbins, Shisheng Xiong, Yongchang Chen, Xiao Xiao
    Number of views: 30
  • 981−992
    The known, unknown, and unknown unknowns of cell-cell communication in planarian regeneration
    Authors: Jia-Jia Chen, Kai Lei
    Number of views: 29

Number 4, 2023

  • 678−692
    Loss of behavioral stress response in blind cavefish reduces energy expenditure
    Authors: Jiang-Hui Zhang, Rui Long, Yang-Yang Jing, Pan Zhang, Yuan Xu, Wei Xiong, Yan-Qiu Zhu, Yi-Ping Luo
    Number of views: 50
  • 701−711
    Genetic identification and reiterated captures suggest that the Astyanax mexicanus El Pachón cavefish population is closed and declining
    Authors: Laurent Legendre, Julie Rode, Isabelle Germon, Marie Pavie, Carla Quiviger, Maxime Policarpo, Julien Leclercq, Stéphane Père, Julien Fumey, Carole Hyacinthe, Patricia Ornelas-García, Luis Espinasa, Sylvie Rétaux, Didier Casane
    Number of views: 51
  • 712−724
    Scopolamine causes delirium-like brain network dysfunction and reversible cognitive impairment without neuronal loss
    Authors: Qing Wang, Xiang Zhang, Yu-Jie Guo, Ya-Yan Pang, Jun-Jie Li, Yan-Li Zhao, Jun-Fen Wei, Bai-Ting Zhu, Jing-Xiang Tang, Yang-Yang Jiang, Jie Meng, Ji-Rong Yue, Peng Lei
    Number of views: 52
  • 750−760
    Evolutionary modifications of Astyanax larval prey capture (LPC) in a dark environment
    Authors: Luis Espinasa, Ruth Diamant, Ehud Vinepinsky, Monika Espinasa
    Number of views: 43
  • 761−775
    Mitochondrial phylogeography and molecular evolution of the rhodopsin visual pigment in troglobitic populations of Astyanax mexicanus (De Filippi, 1853)
    Authors: Marco A.A. Garduño-Sánchez, Vladimir de Jesus-Bonilla, Silvia Perea, Ramses Miranda-Gamboa, Andrea Herrera- García, Mauricio de la Maza Benignos, Claudia Patricia Ornelas-García
    Number of views: 44
  • 782−792
    Host-parasite interactions in perpetual darkness: Macroparasite diversity in the cavefish Astyanax mexicanus
    Authors: Ana Santacruz, David Hernández-Mena, Ramses Miranda-Gamboa, Gerardo  Pérez-Ponce De  León, Claudia Patricia Ornelas-García
    Number of views: 45
  • 793−807
    Metagenomic analysis reveals hidden links between gut microbes and habitat adaptation among cave and surface dwelling Sinocyclocheilus species
    Authors: Hong-Yu Chen, Chun-Qing Li, Shan-Yuan Chen, Hen Xiao
    Number of views: 52
  • 808−820
    Developmental environment contributes to rapid trait shifts among newly colonized subterranean habitats
    Authors: Nathan E. Swanson, Andrew G. Gluesenkamp, Alexandra E. Donny, Suzanne E. McGaugh
    Number of views: 43
  • 821−833
    The first cavefish in the Dinaric Karst? Cave colonization made possible by phenotypic plasticity in Telestes karsticus
    Authors: Mateo Čupić, Zoran Marčić, Marko Lukić, Romana Gračan, Helena Bilandžija
    Number of views: 46

Number 3, 2023

  • 451−466
    Cell atlas of CCl4-induced progressive liver fibrosis reveals stage-specific responses
    Authors: Peng-Cheng Guo, Jing Zuo, Ke-Ke Huang, Guang-Yao Lai, Xiao Zhang, Juan An, Jin-Xiu Li, Li Li, Liang Wu, Yi-Ting Lin, Dong-Ye Wang, Jiang-Shan Xu, Shi-Jie Hao, Yang Wang, Rong-Hai Li, Wen Ma, Yu-Mo Song, Chang Liu, Chuan-Yu Liu, Zhen Dai, Yan Xu, Amar Deep Sharma, Michael Ott, Qing Ou-Yang, Feng Huo, Rong Fan, Yong-Yin Li, Jin-Lin Hou, Giacomo Volpe, Long-Qi Liu, Miguel A. Esteban, Yi-Wei Lai
    Number of views: 57
  • 467−482
    Evolutionary timescale of chalcidoid wasps inferred from over one hundred mitochondrial genomes
    Authors: Jia-Chen Zhu, Hui Xiao, Pu Tang, Xiao-Fei Li, Xuan-Kun Li, Chao-Dong Zhu, Qiong Wu, Jin-Hua Xiao, Cornelis van Achterberg, Da-Wei Huang, Xue-Xin Chen
    Number of views: 54
  • 483−493
    Defining honeybee subspecies in an evolutionary context warrants strategized conservation
    Authors: Lifei Qiu, Jiangxing Dong, Xingan Li, Sajad H. Parey, Ken Tan, Michael Orr, Aquib Majeed, Xue Zhang, Shiqi Luo, Xuguo Zhou, Chaodong Zhu, Ting Ji, Qingsheng Niu, Shanlin Liu, Xin Zhou
    Number of views: 60
  • 494−504
    Reconstructing early transmission networks of SARS-CoV-2 using a genomic mutation model
    Authors: Chao-Yuan Cheng, Zhi-Bin Zhang
    Number of views: 59
  • 505−521
    Transcription factor Dmrt1 triggers the SPRY1-NF-κB pathway to maintain testicular immune homeostasis and male fertility
    Authors: Meng-Fei Zhang, Shi-Cheng Wan, Wen-Bo Chen, Dong-Hui Yang, Wen-Qing Liu, Ba-Lun Li, Aili Aierken, Xiao- Min Du, Yun-Xiang Li, Wen-Ping Wu, Xin-Chun Yang, Yu-Dong Wei, Na Li, Sha Peng, Xue-Ling Li, Guang-Peng Li, Jin-Lian Hua
    Number of views: 58
  • 525−542
    Advances in viral encephalitis: Viral transmission, host immunity, and experimental animal models
    Authors: Dan Yang, Xiao-Jing Li, De-Zhen Tu, Xiu-Li Li, Bin Wei
    Number of views: 55
  • 543−555
    Depletion of microglia with PLX3397 attenuates MK-801- induced hyperactivity associated with regulating inflammation-related genes in the brain
    Authors: Rong-Jun Ni, Yi-Yan Wang, Tian-Hao Gao, Qi-Run Wang, Jin-Xue Wei, Lian-Sheng Zhao, Yang-Rui Ma, Xiao-Hong Ma, Tao Li
    Number of views: 55
  • 559−576
    Outlook of PINK1/Parkin signaling in molecular etiology of Parkinson’s disease, with insights into Pink1 knockout models
    Authors: Zhangting Wang, See-Wing Chan, Hui Zhao, Kai-Kei Miu, Wai-Yee Chan
    Number of views: 58
  • 577−590
    Insights into the genetic architecture of congenital heart disease from animal modeling
    Authors: Wenjuan Zhu, Cecilia W. Lo
    Number of views: 57
  • 591−603
    Large animal models of cardiac ischemia-reperfusion injury: Where are we now?
    Authors: Attaur Rahman, Yuhao Li, To-Kiu Chan, Hui Zhao, Yaozu Xiang, Xing Chang, Hao Zhou, Dachun Xu, Sang-Bing Ong
    Number of views: 56
  • 604−619
    Gradient descent decomposition of force-field motor primitives optogenetically elicited for motor mapping of the murine lumbosacral spinal cord
    Authors: Paola Salmas, Vincent C. K Cheung
    Number of views: 58
  • 620−635
    Extracellular vesicles from iPSC-MSCs alleviate chemotherapy-induced mouse ovarian damage via the ILK-PI3K/AKT pathway
    Authors: Rui-Can Cao, Yue Lv, Gang Lu, Hong-Bin Liu, Wuming Wang, Chunlai Tan, Xian-Wei Su, Zhiqiang Xiong, Jin-Long Ma, Wai-Yee Chan
    Number of views: 54
  • 636−649
    EPAS1 prevents telomeric damage-induced senescence by enhancing transcription of TRF1, TRF2, and RAD50
    Authors: Kai-Qin Li, Gao-Jing Liu, Xiu-Yun Liu, Qiong-Fang Chen, Xiao-Yan Huang, Qiu Tu, Jiao Zhang, Qing Chang, Yun-Hua Xie, Rong Hua, Dong-Ming Xu, Zhen Liu, Bo Zhao
    Number of views: 56
  • 650−662
    Decoding hereditary spastic paraplegia pathogenicity through transcriptomic profiling
    Authors: Nicolas James Ho, Xiao Chen, Yong Lei, Shen Gu
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  • 663−674
    Genome-wide identification and spatiotemporal expression profiling of zinc finger SWIM domain-containing protein family genes
    Authors: Imtiaz Ul Hassan, Hafiz Mamoon Rehman, Ziran Liu, Liangji Zhou, Muhammad Kaleem Samma, Chengdong Wang, Zixin Rong, Xufeng Qi, Dongqing Cai, Hui Zhao
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