Sakarya University Journal of Science

1-8

Authors: Kültiğin ÇAVUŞOĞLU, Emine YALÇIN, Oğuz KUL, Abdullah YILMAZ, Kürşad YAPAR

Micronuclei (MN) test is used as markers of radiosensitivity or chemosensitivity. In present study, it was investigated the frequency of MN in erythrocytes and body weight gain in 80 Mus musculus var. albinos exposed to 10 Gy gamma (γ) radiation and heavy metal ions. For this aim, it was used MN assay as an indicator of genotoxicity induced by γ–radiation and heavy metal toxication. The animals were divided into four groups: control, radiation, Hg and Pb treatment groups. They were treated with three dose levels (10, 15 and 20 μg/mL) of Hg and Pb metal ions and 10 Gy γ–radiaton was applied twice during 14 days. The initial and final weights of all mice were determined by sensitive balance in order to investigate the effect of heavy metal ions and radiation on the weight gain of mice. As a result, the frequency of MN was higher in the Hg, Pb and γ–radiation treated animals than animals in control group. Besides, MN frequency was higher in mice exposed to γ–radiation than in Hg and Pb treated mice, and differences was statistically significant (p<0.05). Histopathologically, periaciner necroses, hydropic degenerations in the liver and villous atrophy in the intestine, gastric glandular mucosae necroses were observed in treatment groups. These results indicate that MN assay is very sensitive and a useful biomarker for the evaluation of the genotoxicity.

16-19

Authors: Semra YILMAZER KESKİN , Kudret YILDIRIM

(-)-Nopol’ün Aspergillus terreus MRC 200365 ve Aspergillus fumigatus MRC 200358 ile biyotransformasyonları geçekleştirildi. A. terreus ile (-)-nopol’ün 7 gün süren inkübasyonu neticesinde (-)-7-hidroksimetil-1-p-menten-8-ol bileşiği elde edildi. (-)-Nopol’ün A. fumigatus ile 7 gün süren inkübasyonu ise başlangıç maddesi ile sonuçlandı.

25-28

Authors: Özgür ALVER, Cemal PARLAK

The magnitude of one bond 1JCH coupling constants, proton coupled 13C NMR and 15N NMR spectra for 2-(1- Cyclohexenyl)ethylamine (CyHEA) molecule have been reported for the first time. 15N NMR chemical shift and 1JCH coupling constants of CyHEA (C8H15N) have been calculated by means of the Becke-3-Lee-Yang-Parr (B3LYP) density functional method with 6-311++G(d,p) basis set. Comparison between experimental and theoretical results indicates that density functional B3LYP method is in good agreement with the experimental NMR data.

33-38

Authors: Fatih APAYDIN, Ahmet ATASOY, Kenan YILDIZ

The carbothermal reduction of mechanically activated chromite with metallurgical coke under an argon atmosphere was investigated at temperatures between 1100 and 1400°C and the effects of the mechanical activation on chromite structure were analyzed by x-ray diffraction (XRD) and scanning electron microscopy (SEM). An increase in specific surface area resulted in more contact points. The activation procedure led to amorphization and structural disordering in chromite and accelerated the degree of reduction and metalization in the mixture of chromite and metallurgical coke. Carbothermal reduction products were analzed by using scanning electron microscopy (SEM/EDS).

45-49

Authors: Ergin Murat ALTUNER, Ilgaz AKATA

Natural products have potential of containing agents for various diseases. When extensive drug resistance is taken into account, the need for the investigation of new antimicrobial substances is essential. In this study the antimicrobial activity of Infundibulicybe geotropa, Lactarius controversus, Lactarius deliciosus and Phellinus hartigii is investigated against Candida albicans ATCC 26555, Escherichia coli ETEC LM 63083, Pseudomonas aeruginosa, Salmonella enterica serotype Typhimirium SL 1344 and Shigella flexneri (clinical isolate). As a result it is observed that all extracts had an antibacterial activity against S. flexneri and all extracts except P. hartigii had an antibacterial activity against P. aeruginosa.

55-61

Authors: Mustafa Kemal BAHAR , Ahmet ERSOY

Bu çalışmada yalıtılmış kare kuantum kuyusuna uygulanan elektrik alanın etkileri pertürbatif ve analitik yöntem ile incelendi. Pertürbatif yöntem kullanılarak kuantum kuyusundaki enerji özdeğerleri ve dalga fonksiyonları bulundu. Daha sonra analitik yöntem ile elektrik alan etkileri incelendi, pertürbatif ve analitik yöntemin sonuçları karşılaştırıldı. Sonuçların ikisinin de birbiriyle uyuşmasının yanısıra, dışarıdan uygulanan elektrik alanın sistemin elektronik özelliklerini önemli bir şekilde değiştirdiği görüldü.

66-76

Authors: Yusuf ZALAOGLU, Asaf Tolga ULGEN, Cabir TERZIOGLU, Gurcan YILDIRIM

The optimized molecular structures including bond lengths and angels of 6-Methyl 1,2,3,4-Tetrahydroquinoline molecule were investigated using density Functional Theory (B3LYP), ab initio Hartree–Fock (HF) and Semi– Empirical models containing Austin Model 1 (AM1), Parametric–Method Number 3 (PM3), Parametric–Method Number 6 (PM6) and Re–parameterization of AM1 (RM1) models in order to characterize the molecule. All the calculated bond lengths and bond angles were observed to be in good agreement with each other. In addition atomic charges, thermodynamic properties, nuclear magnetic resonance (NMR) spectra and ultraviolet visible (UV–Vis) spectra were determined and interpreted for the identification of the molecule. Moreover, we not only simulated frontier molecular orbitals (FMO) and the molecular electrostatic potential (MEP) but evaluated the transition state and energy band gap.

87-97

Authors: Nevim GENÇ

Kinetik modeller, fermentasyonun durumunu nicel olarak açıklamak ve ana değişkenler arasındaki ilişkiyi tanımlamak için kullanılabilir. Ayrıca, kinetik modeller fermentasyon prosesinin analizi, tasarımı ve işletimi için faydalı bilgiler sağlayabilir. Şimdiye kadar fermentatif hidrojen prosesinin nicelleştirilmesi için bazı kinetik modeller geliştirilmiştir. Bu derleme, genel olarak modifiye olmuş Gompertz modeli ve Anaerobik Çürütme Modeli 1 (ADM1)’nın kesikli fermentatif hidrojen üretim prosesinde substrat parçalanması, hidrojen üreten bakterinin büyümesi, hidrojen üretimi ve bazı çözünür metabolitlerin üretimini tanımlamak için kolaylıkla kullanılabildiğini göstermiştir. Modifiye olmuş Gompertz modeli ve ADM1 modeli ile öngörülen ile ölçülen hidrojen gelişim arasındaki korelasyon katsayısı yüksektir, bu modeller hidrojen profilini çok iyi öngörebilecek yeterliliktedir.

106-115

Authors: Erdem UZUN

Termolüminesans olay radyasyon dozlarının ölçülmesinde yaygın olarak kullanılan bir yöntemdir. Bu yöntem ile radyasyon dozlarının ölçülmesinde dikkat edilmesi gereken en önemli nokta termolüminesans ışımayı belirleyen temel tuzak parametrelerinin belirlenmesidir. Bu parametrelerin belirlenmesi ve termolüminesans ışıma mekanizmasının açıklanması için bugüne kadar birçok model ileri sürülmüştür. Bu çalışmada etkileşimli çoklu tuzak modeli incelenmiş, fiziksel modeli yapılmış, model tarafından ileri sürülen diferansiyel denklemler sayısal yöntemler ile çözülmüş ve sonuçlar gerçek malzemeler ile kıyaslanmıştır. Teorik ve deneysel çalışmalardan elde edilen sonuçlar ışığında bu modelin termolüminesans mekanizmayı açıklamadaki başarısı tartışılmıştır.

119-123

Authors: Gülüzar TUNA KELEŞTEMUR, Ünzile KELEŞTEMUR, Sibel SELÇUK

Bu çalışmada, gökkuşağı alabalığı yavrularının kan, kas, karaciğer ve böbrek dokularında malondialdehit (MDA) oluşum düzeyleri üzerine nakil işleminin etkisi araştırılmıştır. Keban Alabalık Ltd. Şirketinden temin edilen yavru gökkuşağı alabalıkları (ortalama ağırlığı: 40,5±0,5 g, ortalama total boyu; 15,4±0,13 cm) Devlet Su İşleri 9. Bölge Keban Barajı Su Ürünleri Şube Müdürlüğü Üretim Tesisine nakil edilmiştir. Nakilden hemen sonra (t-0), 6 saat sonra (t-6) ve 12 saat sonra (t-12) balıklardan alınan kan, kas, karaciğer ve böbrek örneklerinin MDA düzeyleri ölçülmüştür. Nakil işlemi uygulanmamış balıklar kontrol grubu olarak belirlenmiştir. t-0 ve t-6 gruplarının kan MDA düzeyleri, kontrol ve t-12 gruplarına göre daha yüksek bulunmuştur (p<0,05). Kontrol grubu kas MDA düzeyinin diger gruplardan önemli oranda düşük olduğu (p<0,05) belirlenmiş ve en yüksek kas MDA düzeyi t-0 ve t-6 gruplarından elde edilmiştir. Karaciğer dokusunda, t-0 ve t-6 gruplarının MDA düzeyinin, kontrol ve t-12 gruplarına göre daha yüksel olduğu (p<0,05) belirlenmiştir. En düşük MDA düzeyi kontrol grubunun böbrek dokusundan elde edilmiştir.

128-133

Authors: Güven YARKADAŞ, Kenan YILDIZ

Mekanik aktive edilmemiş ve mekanik aktive edilmiş kromitin soda kavurması kinetiği incelenmiştir. Reaksiyonun 700-900°C aralığında difüzyon kontrollü, 900-1200°C aralığında ise kimyasal reaksiyon kontrollü olduğu tespit edilmiştir. Mekanik aktive edilmemiş kromitin soda kavurmasında ilk kademenin aktivasyon enerjisi 170 kJ/mol olup bu değer 30 dakika aktive edilmiş kromit için 141.8 kJ/mol, 120 dakika aktive edilmiş kromit için 79 kJ/mol değerine düşmüştür. İkinci kademenin aktivasyon enerjileri ise aktive edilmemiş kromit için 64.7 kJ/mol, 30 dakika aktive edilmiş kromit için 43 kJ/mol ve 120 dakika aktive edilmiş kromit için 25.1 kJ/mol olarak hesaplanmıştır. Mekanik aktivasyon, kromitin soda kavurması için gerekli aktivasyon enerjisini düşürmüştür.

141-145

Authors: Serpil HALICI, Ahmet DAŞDEMİR

In this study, Pell, Pell-Lucas and Modified Pell numbers are investigated. Using Binet formulas for these sequences, some relationships among these sequences are obtained. Also, some sum formulas are given by these properties.